第154章Sanger基因测序法
吴哲闪过刚刚看的资料,脑中是有那么一点想法的。抬头回道:
“嗯,有点想法,可是资料和数据还是太少,我需要郑师兄帮我一起弄数据。”
唐梦精神不由一震,她是知道吴哲不是信口开河的人,连忙道:
“其实你可以直接开口的,郑师兄人不错,对我们这些学弟学妹还是很照顾的。”
吴哲点了点头:“呃,我看出他人不错,不然也不会真想着帮他减肥。真当我没事喜欢给人画画啊!”
“那你给我说说,你有什么想法?”唐梦露出好奇的神色。吴哲这才来一个上午,就有所发现。她也想听听吴哲的想法,科研不怕错,就怕没方向。
吴哲笑着道:“说起来容易,可能不能实现还两说呢?我觉着有两个方面可以着手,一是更换现在统计数据的算法,从数学方面入手,看能不能优化。第二则是考虑能不能更换以前的测序方法。”
唐梦听完也是连连点头。对着吴哲说道:“阿哲这两种方法第一种还有可能,但是第二种的话很难,现在的测序标准你应该也知道,两种方法都是二十多年前的方法。经过这么多年了,从来没有人再提出新的理论出来。”
现在的基因测序所用方法还是用的上世纪70年代年由桑格(Sanger)和考尔森开创的链终止法或者是由马克西姆和吉尔伯特发明的化学法(链降解)
Sanger法的核心原理是:由于ddNTP(4种带有荧光标记的A,C,G,T碱基)的2’和3’都不含羟基,其在DNA的合成过程中不能形成磷酸二酯键,因此可以用来中断DNA的合成反应,在4个DNA合成反应体系中分别加入一定比例带有放射性同位素标记的ddNTP(分别为:ddATP,ddCTP,ddGTP和ddTTP),然后利用凝胶电泳和放射自显影后可以根据电泳带的位置确定待测分子的DNA序列。
这个方法现在是主流测绘方法,后面出现的焦磷酸测序法、连接酶法等等,他们的核心手段都是利用了Sanger中可中断DNA合成反应的dNTP。所以现在的手段基本脱不开Sanger法。
所以唐梦才会说吴哲想要创造一种新的测绘方法会非常难。
吴哲笑了笑道:“我只是有这么个想法而已,先从Sanger法上,看看数据计算上面能不能改进下方法吧!然后我要亲自试验下Sanger法的操作,别让人觉着我进了基因所后,连个上手都不会。”
“那简单,烦就烦在基因比对和读取上,Sanger法的操作,基本所里的人都会。要不我教你?”唐梦娇笑着看着吴哲,难得能碰上吴哲不会的。
“干嘛这么看着我?我又没上
请收藏:https://m.biquge777.com
(温馨提示:请关闭畅读或阅读模式,否则内容无法正常显示)